Svou bojovnou povahu mohl Jiří Novotný všem naplno ukázat už ve svých sedmnácti letech. Jako poměrně mladý začal hrát Extraligu za HC Mountfield. V roce 2002 zazářil natolik, že byl draftován oslněným týmem Buffalo Sabres. Po další sezoně se tak dostává konečně za oceán, aby mohl pokračovat ve své budoucí kariéře. Dostal šanci. A taky ji během následujících tří let v Rochestru nepromarnil.
V roce 2006 se tak konečně stal právoplatným členem Buffala. Po necelých dvou sezonách přešel Jiří Novotný do Washingtonu. Ani tady se však dlouho neohřál. Zlákaly ho „modré kabátky“ (Columbus Blue Jackets). Ale i tenhle kabátec po dvou sezonách odhodil, protože přišla mnohem neodolatelnější nabídka. Zlákala ho KHL. V sezóně 2009/2010 tak konečně mohl obléknout dres Atlantu.
Následovala skvělá sezona, na jejímž konci přivítala Jiřího Novotného s otevřenou náručí kazašská Astana. Ve svých úspěších nadále pokračoval a nakonec ho v roce 2012 vítr přivál ke Lvům z Prahy, kterým začal dělat kapitána. Za poslední tři roky „ukousl“ kus slávy na MS 2010 v Německu, odkud si Česká reprezentace odvezla zlato a nechyběl ani u bronzových medailí na MS ve Finsku a na Slovensku.
Jiří Novotný je ženatý, s manželkou Zuzanou mají od roku 2008 syna Jirku.