Roku 1987 Michaela Pavlátová absolvovala ateliér animovaného filmu na Vysoké škole uměleckoprůmyslové v Praze.
MICHAELA PAVLÁTOVÁ - ROZHOVOR PRO REFLEX.CZ
Prvním krátkometrážním snímkem Michaely Pavlátové byla kreslená groteska na téma "manželské judo" Etuda z alba (1987); další pak komedie Křížovka (1989).
Hned třetí animovaný snímek Michaely Pavlátové Řeči, řeči, řeči… (1991) byl nominována na Oscara. Za kreslený snímek Repete (1995) získala na Berlinale Zlatého medvěda v kategorii krátkých filmů.
V roce 2000 Michaela Pavlátová debutovala hraným příběhem Absolutní láska z povídkového snímku Praha Očima. Následující rok zaujala svým dokumentem O babičce.
V roce 2003 Michaela Pavlátová natočila svůj první celovečerní film Nevěrné hry, který byl oceněn Zvláštní cenou poroty na Mezinárodním filmovém festivalu v San Sebastiánu. Její Karneval zvířat získal v roce 2006 hlavní cenu Grand Prix na MF animovaného filmu v Třeboni a Grand Prix v Espinhu (Španělsko).
Drama Michaely Pavlátové Děti noci (2008) vyneslo na Karlovy Vary IFF vítězství Marthě Issové za nejlepší ženský herecký výkon a Jiřímu Mádlovi za ten nejlepší mužský. Českého lva si za režisérčin snímek odnesla Lenka Termerová, a to v kategorii Nejlepší herečka ve vedlejší roli.
I ona, tedy výtvarnice, režisérka a animátorka Michaela Pavlátová, se předvedla coby herečky, a to mj. ve filmech Pražská 5 (1988), Knoflíkáři (1997), Musím tě svést (2002) nebo ve Fair Play (2014).
Michaela Pavlátová se pustila také do pedagogické činnosti - v Praze na FAMU a VŠUP, v San Franciscu a na Harvardu.