U Krajské hygienické stanice Moravskoslezského kraje Pavla Svrčinová působila jako ředitelka odboru hygieny výživy a předmětů běžného užívání. V letech 2009 až 2015 pracovala na auditech pro kontrolní systémy bezpečnosti potravin na Generálním ředitelství pro zdraví a bezpečnost potravin Evropské komise.
V roce 2016 se Pavla Svrčinová zúčastnila výběrového řízení na funkci hlavní hygieničky, tou se však tehdy stala Eva Gottvaldová, kterou v rámci pandemie koronaviru vystřídala Jarmila Rážová.
Poté Pavla Svrčinová byla ředitelkou Sekce ochrany a podpory veřejného zdraví Hygienické stanice hlavního města Prahy.
V lednu 2020 se Pavla Svrčinová, která se též věnuje přednášení a pedagogické činnosti, stala ředitelkou Krajské hygienické stanice Moravskoslezského kraje.
V březnu 2021 premiér Andrej Babiš (ANO) oznámil, že Pavla Svrčinová nahradí dosavadní hygieničku ČR Jarmilu Rážovou.
V listopadu 2021 byla Pavla Svrčinová pozitivně testována na koronavirus.