S natáčením videoklipů a reklamních či propagačních spotů začal již jako čtrnáctiletý školák. Ve světě filmařiny Matěj Chlupáček uspěl i přesto, že nemá žádné odborné vzdělaní.
Coby producent celovečerního snímku Matěj Chlupáček debutoval v roce 2014. Šlo o psychologickou tragikomedii Hany. Dále produkoval drama Polednice (2016).
Jako jeden z produkčních byl Matěj Chlupáček v roce 2018 nominován na Českého lva za krimi sérii Profesor T. v kategorii Nejlepší televizní seriál. Sošku krále zvířat si společně s kolegy odnesl roku 2020 za seriál Zrádci, který na Cenách české filmové kritiky dostal Cenu „Mimo kino“.
Dále se Matěj Chlupáček podílel na produkci thrilleru Stínohra (2022) či životopisného seriálu Iveta. Na Českého lva byl nominován také roku 2022 za minisérii Pozadí událostí.
Podíl na produkci a režijní celovečerní debut krimi dramatu Úsvit (2023) Matěji Chlupáčkovi vynesl nominaci na Cenu české filmové kritiky a Českého lva za nejlepší film a režii. Nakročeno snímek měl i na Křišťálový glóbus na Mezinárodním filmovém festivalu Karlovy Vary.